Através de um acordo assinado com o Conselho Municipal de Maputo, a FUNDE tem um conjunto de escolas primárias públicas que deve gerir, aproveitando a experiência de gestão da Universidade Politécnica. Actualmente a FUNDE está a gerir a 1a das 5 escolas: Escola Primária 25 de Junho, localizada no bairro 25 de Junho, Rua 7. A FUNDE já promoveu algumas actividades visando angariar apoios para a Escola. Neste momento as infra-estruturas da Escola estão a ser reabilitadas e está em curso um programa pedagógico de acompanhamento dos docentes, visando fornecer-lhes novas práticas pedagógicas.